執亞洲棒壇牛耳的日本，是亞錦賽創始的會員國之一，在這亞洲棒球最大的賽事中，留下了輝煌的戰績，從1954年馬尼拉亞錦賽開始，一直到2005宮崎亞錦賽為止，23屆總共奪下了15次冠軍，另外包含7次亞軍、1次季軍。

攸關奧運參賽權的亞錦賽，派出職棒精英出戰，一向是日本隊打亞錦賽的方針，即便如此，他們還是留下耀眼的成績，曾經寫下3度3連霸的紀錄，即便在非關奧運資格的亞錦賽中，也會看見不少未來之星，例如1989年亞洲盃，當時陣中擁有野茂英雄、潮崎哲也、古田敦也等人，這些球員後來都在職棒發光發熱，其中野茂甚至渡海挑戰美國大聯盟，2001年的亞錦賽和余文彬演出精采對決的新垣渚，後來成為福岡大榮鷹（現軟體銀行）的王牌投手，顯見日本棒球人才濟濟。

在80年代到90年代初期，日本隊與中華隊常常在國際賽殺得難分難捨，亞錦賽是兩軍交鋒最激烈的戰場，1983年的亞錦賽預賽，日本隊預賽對中華隊，第9局下2人出局滿壘的情況下，由於一壘手趙士強的漏接，日本隊以5比4擊敗中華隊，到了複賽卻被趙士強在9局下擊出陽春全壘打，0比1敗北，兩隊的恩怨情仇後來也延續到了奧運賽場。

2003年亞錦賽，可說是日本隊史上最星光閃爍的一屆，連總教練都是由赫赫有名的長島茂雄執掌兵符，旗下擁有松?大輔、和田毅、城島建司、福留孝介、小笠原道大等台灣球迷耳熟能詳的球員，果然不負眾望，勢如破竹地擊敗中華、韓國與中國，順利摘金並挺進雅典奧運。

日本隊在1955、59、62(2至4屆)達成隊史首次亞錦賽3連霸，接著在1965、67、69年(6至8屆)再次完成3連霸，進入90年代後，日本棒球實力持續精進，基層棒球培育出許多優秀選手，職棒發展也遇見成熟，實力不斷進步的結果，穩坐亞洲棒球龍頭，，1989、91、93年(16至18屆)第3次達到3連霸的紀錄，帶給韓國與台灣不小的衝擊，韓國和中華向日本職棒看齊，持續培育人才之外，也致力提升職棒水準，使得亞錦賽又成為3國鼎立的局面，可是近兩屆(2003與05年的第22、23屆)都在日本舉行，他們都以冠軍作收。