日職選秀於29日下午展開，備受矚目的「20年難得一見奇才」菊池雄星，雖未如先前預期締造史上最多球團指名的紀錄，不過卻也同時獲得6支球團的青睞，而經過抽籤之後確定由西武幸運抽中這位當紅人氣天王。
下午4點日本職棒會長加藤良三宣佈2009年選秀會正式開始，緊接著12支球團同時公佈第一指名的選手，結果共有樂天、日本火腿、西武、阪神、中日及養樂多等6支球團同時指名菊池雄星。
依照慣例重覆指名的話，必須採取抽籤的方式來決定哪支球隊擁有選手的交涉權，結果第一位抽籤的西武監督渡邊久信，就以他那幸運的右手抽中了上上籤，取得菊池雄星的交涉權，令其他球隊扼腕不已。
選秀會議前就表明放棄挑戰美國職棒，決心在日本職棒先闖出一番成績的菊池雄星，曾經說過不管被哪一支球隊抽中都願意加入，因此菊池明年批上西武獅戰袍幾乎是已成定局。
1998年西武隊在選秀會上抽中了被譽為「10年逸才」的平成怪物松坂大輔，11年後又幸運地抽中美日職棒都爭相拉攏的「20年難得一見奇才」菊池雄星，這只能說西武真的與高中超級球星太有緣了。
至於其他球隊的第一指名選手分別是：
巨人---長野久義（HONDA 外野手）、中日---岡田俊哉（智辯和歌山高校 投手）、養樂多---中澤雅人（TOYOTA自動車 投手）、阪神---二神一人（法政大學 投手）、廣島---今村猛（清峰高校 投手）、橫濱---筒香嘉智（橫濱高校 內野手）。
日本火腿---中村勝（春日部共榮高校 投手）、樂天---戶村健次（立教大學 投手）、軟體銀行---今宮健太（明豐高校 投手）、羅德---荻野貴司（TOYOTA自動車 外野手）、歐力士---古川秀一（日本文理大學 投手）。
